Честно говоря, не знаю как будет влиять, но я обычно, не дублирую. Хотя есть такие сайты которые на некоторые разделы дублируют ... тоже особых пессимизаций не видел. Смысл только дублировать в больших количествах?
Как по мне это переюзабилити ... Юзабилит - это когда вы делаете так, что с 1 строки,кнопки,виджета и т.д. всё понятно, а если вы обтыкаете ссылками на меню, резделы, сайт по кругу, то какое ж это юзабилити?
Дубли - плохо, юзабилити - хорошо. Выбирает каждый сам для себя. Если дубли реально нужны для удобства и повышения CRT я бы оставил. Если это лишний мусор - удалил. Следует проанализировать сайт метрикой. Нужно ли это вообще, а потом уже принимать решение.