[Unrealm]

Скажите пожалуйста, с точки зрения сео оптимизации, какой лучше сделать домен, если сайт будет мультиязычный?
1) ua.site.com
us.site.com
2) site.com/ua
site.com/ru

Если кто может, скажите какая будет в них разница, повлияет ли это как то на наращиваеи тиц, пр?

[semyon]

какая будет в них разница

повлияет ли это как то на наращиваеи тиц, пр

ru.site.com и ua.site.com - разные сайты...
site.com/ru и site.com/ua - один и тот же...

[MESAZ]

2) site.com/ua
site.com/ru

Мне кажется, что так лучше.
Там идёт домен 3 уровня и совершенно другие SEO данные.
Для оптимизации лучше 2 вариант.

[VictorSamus]

Unrealm,второй вариант, будет лучше для оптимизации и для пользователей.

[hammer8]

2) site.com/ua
site.com/ru

Такой вариант лучше всего. Обычно так всегда делается.

повлияет ли это как то на наращиваеи тиц, пр?

Пр первом варианте у каждого поддомена будет индивидуальный тиц и pr, что не подходит в вашей ситуации.