Бред какой то основная масса людей пишет, складывается такое впечатление что большинства людей вообще не имеют представление весь механизм перелинковки и ее действие. Повторюсь еще раз что на "автомате" не как не получится сделать грамотную перелинковку, всякие "колдунщики" и прочая автоматическая шняга все это вчерашний день и не ведитесь на весь этот шлак как маленькие дети. Во первых надо сделать полный анализ сайта и выявить страницы с наибольшем статическим весом, во вторых убрать все ссылки которые способствуют утечки веса вашего сайта, в третьих надо путем перелинковки распределить вес сайта.
Все это конечно же я образно описал и в двух словах, но думаю что даже из того что я написал уже по моему ясно что качество достигается только при помощи ручной перелинковки.
Линкоскоп делает лишь анализ сайта указывая статический вес по отдельности, так же показывает битые ссылки и не более того. Грамотная автоматическая перелинковка это не реально, забудьте об этом, на улице уже 2015 год а не начало 2000-ых.
BROKER, у ТС как он выразился много миллионов страниц. Я даже не представляю сколько это работать надо + работа над самописным движком. Односначно сайт заполнен автоматом, а соответственно и линковать его тоже нужно было автоматом и ни про какое качество такого сайта как и контента на нем речи быть не может. Был бы серьезный проэкт то вопросов бы таких небыло. А так, как я советывал в соседней теме - легенько Хрумером + карты в адурилку загнать, и ждать