[izyalex]

Что делать дальше?

Ответ напрашивается сам собой чистить.
Вы спросите как? Ответят: ручками, блокнотом, Notepad++ ....
....

[mmi]

izyalex, удалять полностью строку, которую нашел сканер? или только слово, которое он подсвечивает красным, как злой код?
Еще есть много вот такого:
Вставка рекламных кодов, sape и другие возможно чужеродные
($key = 0, $rel = 'alternate') { $links = $this->Get_Links($rel); if (isset($links[$key])) { return $
Сомнительные файлы с длинным закодированным содержанием
eater than 512 bytes, even after gzip compression abcdefghijklmnopqrstuvwxyz1234567890aabbccddeeffgg hhiijjkkllmmnnooppqqrrssttuuvv
a="bbbbbbbbbtstwsbbbbbbbbbbbbbbssstwNN%%%NNNNNN,N, N1111111111NNNNNNNLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLNNNNNN LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLNNNN
и т.д.

Это тоже удалять? оно распознается как подозрительное.

[genesis33]

Обновляйте JCE регулярно, тем более это с адимнки в компоненте легко и просто сделать и все будет ок у вас.