Собственно вопрос в сабже - есть ли какие-нибудь онлайн сервисы или программы для проверки корректности всех правил в htaccess. Просто есть подозрение, что некоторые правила не отрабатываются...
Сторонний сервис/валидатор найдет синтактические ошибки или, в лучшем случае, зацикленные редиректы.
Если в вашем .htaccess прописаны правила с помощью директивы RewriteRule, то вы НЕ сможете проверить правила никаким сторонним сервисом, пч регулярные выражения [внутри RewriteRule], реализуют определенную логику, которую в них закладывал разработчик.
И только специалист может разобраться в прописанных алгоритмах, сопоставить их с тем, что должно происходить, и что на самом деле происходит (или не происходит) на вашем сайте при их выполнении. И затем дать ответ насколько эти алгоритмы правильные или нет для функциональности сайта.