Если нужно большое количество страниц, например по сапу, то конечно ничего закрывать не стоит. А если это более белый сайт, то лучше закрывать. С этим прекрасно справляется плагин All seo in pack, который автоматически добавляет мета теги ноиндекс в страницы тегов и категорий.
Но, например у Терехова, теги открыты точно для индексации, и их можно довольно часто замечать в топе выдачи.
Придерживаюсь рекомендациям поисковиков - закрываю в роботсе профили пользователей, не важные страницы, дубляж. Кажется что Яндексу нравится - страницы новые быстрее индексируются.
Категории не закрываю, а вот теги по разному: на одном есть так что теги закрыты от индексации только для Яндекса, на другом открыты для всех ПС, А есть и полностью закрыты.